Les cours d'eau suivants sont ouverts à la navigation non motorisée:
- la Sarine, y compris son cours limitrophe avec le canton de Berne; toutefois, le tronçon Rossens–Hauterive n'est ouvert à la navigation qu'en cas de crue artificielle;
- la Singine (depuis Zollhaus jusqu'au confluent de la Sarine, à Laupen), y compris son cours limitrophe avec le canton de Berne;
- la Singine chaude (depuis sa sortie du lac Noir jusqu'au confluent de la Singine froide);
- la Singine froide (en aval du confluent de la Muscherensense, à Sangernboden, jusqu'au confluent de la Singine chaude, à Zollhaus), y compris son cours limitrophe avec le canton de Berne;
- la Broye, y compris son cours limitrophe avec le canton de Vaud;
- la Gérine;
- le canal de la Broye, entre le lac de Morat et le lac de Neuchâtel.
Seul le canal de la Broye, entre le lac de Morat et le lac de Neuchâtel, est ouvert à la navigation motorisée.
Les restrictions locales de navigation prononcées en application de la législation spéciale demeurent réservées.