Folgende Kommissionen, andere Organisationseinheiten (ohne Ämter) und Sachbereiche wechselten per 1. Januar 1999 die Direktion:
| 1. * | … | ||||
| 2. | Kommission für die Prüfung der Gemeindeschreiber und deren Stellvertreter im Beurkundungsrecht: von der bisherigen Justiz- und Polizeidirektion zur Direktion des Innern | ||
| 3. | Jagdkommission: von der bisherigen Forstdirektion zur Direktion des Innern | ||
| 4. | Prüfungskommission für Jäger: von der bisherigen Forstdirektion zur Direktion des Innern | ||
| 5. | Fischereikommission: von der bisherigen Forstdirektion zur Direktion des Innern | ||
| 6. | Interkantonale Försterschule Maienfeld: von der bisherigen Forstdirektion zur Direktion des Innern | ||
| 7. | Konkordatskommission Fischerei im Zugersee: von der bisherigen Forstdirektion zur Direktion des Innern | ||
| 8. | Kantonale Schiesskommission: von der bisherigen Militärdirektion zur Sicherheitsdirektion (untersteht jedoch 1999/2002 dem Stellvertreter des Vorstehers der Sicherheitsdirektion) | ||
| 9. | Verwaltungskommission des Winkelriedfonds: von der bisherigen Militärdirektion zur Sicherheitsdirektion (untersteht jedoch 1999/2002 dem Stellvertreter des Vorstehers der Sicherheitsdirektion) | ||
| 10. | Kommission für den Steuerausgleich unter den katholischen Kirchgemeinden: von der bisherigen Erziehungs- und Kultusdirektion zur Finanzdirektion | ||
| 11. | Schlichtungsbehörde in Mietsachen: von der bisherigen Justiz- und Polizeidirektion zur Volkswirtschaftsdirektion | ||
| 12. | Schlichtungsstelle für die Gleichstellung von Frau und Mann: von der bisherigen Justiz- und Polizeidirektion zur Volkswirtschaftsdirektion | ||
| 13. | Sachbereich «Kultus»: von der bisherigen Erziehungs- und Kultusdirektion zur Direktion des Innern | ||
| 14. | Sachbereich «Aufsicht betreffend öffentliche Ruhetage und Öffnungszeiten der Verkaufsgeschäfte»: von der Finanzdirektion zur Volkswirtschaftsdirektion | ||
| 15. * | Sachbereich «Aufnahmeverfahren für die Brückenangebote»: vom Bildungsrat zur Volkswirtschaftsdirektion | ||