Le canton de l'autorité de placement rembourse les frais d'exécution au canton de l'autorité d'exécution. La possibilité de recourir contre d'autres débiteurs est réservée.
L'indemnité est fixée en tenant compte des tâches des divers établissements. La conférence détermine quelles prestations sont couvertes par l'indemnité et quels standards doivent être respectés pour que l'indemnité puisse être exigée.
Le relevé des frais d'exécution et les paiements compensatoires sont régis par les articles 27 et suivant de l'Accord-cadre du 24 juin 2005 pour la collaboration intercantonale assortie d’une compensation des charges (ACI). Le calcul prévoira une imputation de l'avantage de site, déterminé par la conférence selon un modèle de calcul reconnu. La conférence définit en outre le taux d'occupation nominal des établissements concordataires pour les diverses catégories d'exécution des peines et mesures.
Les établissements de même catégorie doivent appliquer des montants d'indemnité uniformes. Afin de parvenir à ce but, la conférence peut constituer par le biais des suppléments d'indemnité un fonds destiné à subventionner les investissements de construction (fonds de construction). Le fonds est alimenté par un supplément d'indemnité de 5 francs par jour au plus, versé par le canton de l'autorité de placement. Le montant maximal est indexé selon l'indice zurichois des prix de la construction de logements (valeur au moment de l'entrée en vigueur de la présente convention; base: 100 points au 1er avril 1998).