Le canton verse des indemnités pour les fonctions pastorales exercées lors de la suppléance d'une personne titulaire d'un poste d'ecclésiastique rémunéré par le canton absente pour cause de maladie, d'accident, de service militaire, de service civil ou de service dans la protection civile, de travail au sein du Care Team, de congé de maternité, de congé à titre de prime de fidélité ou de congé non payé, ainsi que lors de la vacance d'un poste.
Les frais de suppléance pour toutes les autres absences sont à la charge des paroisses.
Les suppléances indemnisées par le canton dans les paroisses réformées évangéliques doivent être organisées avec le concours du pasteur ou de la pasteure de région.